Zwyczajowo jest przyjęte, że koszty związane z umową sprzedaży ponosi strona kupująca. Oczywiście nic nie stoi na przeszkodzie, jeżeli strony dojdą do porozumienia, aby koszty związane z zawarciem umowy sprzedaży ponosiła strona sprzedająca. Oczywiście cena określona w akcie notarialnym powinna odpowiadać wartości rynkowej lokalu, w innym wypadku może to spowodować wszczęcie postępowania podatkowego w celu określenia właściwej wysokości zobowiązania podatkowego. Dokładne koszty związane z umową sprzedaży obliczy i pobierze notariusz, który będzie sporządzał akt notarialny. Przy cenie 50 000 złotych całkowite koszty związane z umową sprzedaży spółdzielczego własnościowego prawa do lokalu nie powinny przekroczyć 1800 zł.

Do niedawna osoby nabywające spółdzielcze własnościowe prawo do lokalu ponosiły jeszcze jedną obowiązkową opłatę, a była nią opłata za przyjęcie w poczet członków spółdzielni, gdyż aby skutecznie nabyć taki lokal, oprócz aktu notarialnego nowy nabywca musiał być przyjęty w poczet członków spółdzielni. Sprawą obowiązkowego członkostwa w spółdzielni zajął się Trybunał Konstytucyjny, który orzekł, że art. 17/2 ustawy o spółdzielniach mieszkaniowych, uzależniający skuteczność zbycia spółdzielczego własnościowego prawa do lokalu od przyjęcia nabywcy w poczet członków spółdzielni, jest niezgodny z Konstytucją. Obecnie więc osoba, która nabywa spółdzielcze własnościowe prawo do lokalu, nie musi uzyskać członkostwa w spółdzielni.