Do opłaty rocznej za użytkowanie wieczyste gruntu ustanowionej przed 1 maja 2004 roku trzeba doliczyć VAT. Zatem opłata roczna nie jest kwotą brutto, organy samorządu nie będą musiały płacić 22% VAT z własnej kieszeni i mogą do opłaty doliczyć podatek – stwierdził Wojewódzki Sąd Administracyjny w Warszawie. W przedmiotowej sprawie starosta miał wątpliwość, jak opodatkować VAT-em opłaty za użytkowanie wieczyste ustanowione przed 1 maja 2004 r., czyli przed wejściem w życie nowej ustawy o VAT. Naczelnik urzędu skarbowego uznał, że opłata, którą otrzymuje starosta, jest kwotą brutto (z VAT). Starosta z tym się nie zgodził i złożył zażalenie do izby skarbowej. Okazało się to bezskuteczne, więc sprawa trafiła do WSA, gdzie starosta wskazał, że interpretacja jest krzywdząca dla organu samorządu. Opłaty za użytkowanie wieczyste były ustalane na długie lata, a przepisy praktycznie uniemożliwiają ich zmiany, określając ściśle sytuacje, w jakich można to zrobić. WSA uznał skargę za zasadną, a uchylając interpretację organów podatkowych uznał je za błędne. W ocenie sądu prowadzi ona do tego, że VAT traci konsumpcyjny charakter, co jest przecież jednym z jego elementów podstawowych. Zdaniem sądu interpretacja organów prowadzi też do zróżnicowania podatników. Jednostki samorządu, które ustanowiły opłaty wcześniej niepodlegające VAT, byłyby w gorszej sytuacji niż inni, którzy po zmianie przepisów mogli doliczyć VAT.

Wyrok WSA w Warszawie z dnia 05.10.2005 roku sygn. akt III SA/Wa 1935/05